Если не отображаются партнеры в списке

То просто наверняка при переносе или прочем программном создании партнеров был забыт регистр сведений "Иерархия партнеров". В простейшем случае туда достаточно записать и партнера, и родителя равным партнеру, например, использовав подбор и обработку объектов (из инструментов разработчика) со следующим произвольным кодом:

Менеджер = РегистрыСведений.ИерархияПартнеров.СоздатьМенеджерЗаписи();
Менеджер.Партнер = Объект.Ссылка;
Менеджер.Родитель = Объект.Ссылка;
Менеджер.Записать();